aminoXpress

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　　aminoXpress是一款专为生物化学行业设计的CAD应用软件，可以用套用的方法来处置用户复杂的生物化学问题。是一款功用丰厚且适用的多功用生物化学包集成。

根本简介

　　aminoXpress集成了生物化学家每天执行的常见功用。除了传统的序列输入协议之外，该程序还提供了一种新的经过构建模块和相应计数输入序列的协议。这为程序处置十分复杂、分支、循环和冗长的序列提供了可能性。该程序还经过其用户可定义的片段数据库将其适用范围扩展到普通有机化学。

功用引见

　　1.氨基酸剖析:该模块计算氨基酸剖析结果的最佳残基比。经过将水解过程中容易氧化的残留物输入“未优化残留物”局部，能够将对优化结果的影响降至最低。

　　2.复合构建模块组成:该模块基于构建模块(氨基酸、片段)具有离散的重量值这一事实来辨认不测产品的身份。扫描它们的组合后，偏向最小的更有可能是衍消费品。

　　3.消化形式:该模块经过用户定义的酶或化学形式预测消化产物。

　　元素剖析:该模块计算序列中不同元素的理论百分比。经过进一步输入每个元素的实验百分比组成，能够辨认其经历公式和/或其汇集体。

　　4.碎片化:该模块预测质谱中经过三品种型的键断裂产生的碎片:一氧化碳/一氧化碳、一氧化碳/碳氢化合物和碳氢化合物/碳氢化合物。生成的碎片能够直接导入到质量模块中，用于模仿质量散布形式。

　　5.螺旋轮/网:这个模块显现和操作螺旋构造的次第轮/网显现。

　　6.同位素散布图:这个模块预测输入公式或序列的同位素散布图，以1到3的电荷变化的或形式

　　7.Lib组合库:本模块预测组合库(如肽库)的质谱，以1-3电荷的或形式停止。直到最后一步才停止质量舍入，以确保精确性。此外，该模块将其预测才能扩展到有机文库:随机变体能够是氨基酸、片段或两者兼有。结果还包括随机的截面剩余组合

　　8.主题发现:该模块经过形式辨认预测序列中潜在的药物活性位点。它有助于扫描预设形式或随机反复形式、潜在的药效团，以及展现相同生物活性的加载序列。

　　9.分子量:这个模块计算肽和蛋白质的分子量。输入能够经过常规的序列计划停止，也能够经过构建模块如氨基酸和片段停止。替代计划使模块可以计算复杂分子的分子量，例如具有维护基团的肽、肽模仿物、长分子和分支分子等。原子量的进一步运用通常扩展了模块计算任何化合物分子量的才能。

　　辅助描绘

　　10.数据库数据库管理:这个辅助模块允许用户管理在这个程序中运用的一切数据库，如氨基酸数据库，片段附加数据库...等等。开放式设计允许用户依据他们的特定项目定制数据库。

　　11.序列序列加载器:这个辅助模块允许用户将序列加载并解析到相应模块的入口局部。专家系统自动辨认诸如侧链、环状构造、假交换和附加加合物的属性。

　　日语丸