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R语言读取数据 R语言-怎样读取前n行数据

炫炫有牛腩   2021-04-22 我要评论
想了解R语言-怎样读取前n行数据的相关内容吗,炫炫有牛腩在本文为您仔细讲解R语言读取数据的相关知识和一些Code实例,欢迎阅读和指正,我们先划重点:R语言,读取数据,前n行,下面大家一起来学习吧。

通常我们读取文件时都会读取全部的文件然后再进行操作,但是当读取的数据量很大是读取的时间会很长,而且占用RAM,对于写测试代码有点不方便。

所以只读取前n行数据是一个挺不错的函数

##file:读取文件路径
##n:读取的前n行
##header:是否有标题行
readfile<-function(file, n=1000, header=T){
  pt <- file(file, "r")
  name <- NULL
  if(header){
    name <- strsplit(readLines(pt, 1), split=',')[[1]];  #读取标题
    f1 <- readLines(pt, n)
    data <- read.table(text=f1, sep=',', col.names=name)
  }else{
    data <- read.table(text=f1, sep=',')
  }
  close(pt)
  data 
}

测试,最近制作linux启动盘误将移动硬盘当U盘,要死要死的,近500G资料丢失,因为制成启动盘所以资料还找不回来。

所以没有大型数据做测试。

之前200M的文件本人电脑上读取前10000行也是秒读的。

(data <- readfile(file="mtcars.csv", n=5, header=T))
       X..        X.mpg. X.cyl. X.disp. X.hp. X.drat.  X.wt.
1       Mazda RX4   21.0    6   160     110    3.90   2.620  
2   Mazda RX4 Wag   21.0    6   160     110    3.90   2.875  
3      Datsun 710   22.8    4   108      93    3.85   2.320  
4  Hornet 4 Drive   21.4    6   258     110    3.08   3.215  


class(data)
[1] "data.frame"

补充:R语言(数据读写操作)

本节介绍一些实用的数据处理函数(如行、列合并),以及如何从各种数据源读、写数据。

实用函数

函数 含义
length() 对象的长度。如 2 行 3 列的矩阵,其长度为 6。
dim() 对象的维度。如 2 3 表示对象是二维的,有 2 行 3 列。
str() 对象的结构。常用于查看数据框各列的数据类型、或者因子的分级数量。
class() 对象的类。比如矩阵的返回结果是 matrix。
typeof() 对象内数据的类型。比如矩阵的返回结果是 integer。
mode() 对象的模式。比如矩阵会返回 numeric。
names() 对象中各成分的名称。
cbind() 按列合并多个对象。
rbind() 按行合并多个对象。
objectname 输出对象。
head() 输出对象的前部,对于数据框而言是前6行。通过 head(obj, N) 来指定输出前 N 行。
tail() 类似地,输出对象的后部。
ls(NULL) 无参数函数。显示当前所有对象的名称列表。
rm() 删除单个或多个对象。使用 rm(list = ls()) 可以删除除句点开头的隐藏对象外的所有对象。

一个 ls() 函数的例子:

a <- matrix(1:6, nrow=2, ncol=3)ls() # 目前的对象只有 a

‘a'

手动输入

使用需要赋值的 edit() 函数,或者无需写在赋值语句内的 fix() 函数。

dt <- data.frame(age = numeric(0), gender = character(0), weight = numeric(0))# dt <- edit(dt)  # 需要自赋值# fix(dt)  # 无需自赋值

遗憾的是,在 Jupyter Notebook 现行的版本中,尚且不支持 edit() 函数。不过用户可以使用 fix() 函数。

读取文件

关于怎样读取来自 URL 地址的网络文件,R 可以实现,但这里不做讨论。以下只讨论本地数据源的读写。

分隔符文件

利用 read.table() 函数即可。其常用的参数有:

read.table(file, [header=T/F, sep=" ", row.names=, col.names=, na.strings=, 
       colClasses=, quote=, skip=, stringAsFactors=T/F,])

其中,可选参数的含义大多较好理解:

header 表示文件首行是否是列名而不是数据;

sep 是列间分隔符;na.strings 指定一个字符向量,内部所有的元素在读取时会被转换为 NA;

colClasses 用于指派各列的类型,如 =c(“numeric”, “character”, “NULL”) 指定了前两列的类型并跳过了第三列;

skip 用于跳过文件的最开始的若干行;

stringAsFactors 为 TRUE(默认值)时表示字符向量按因子处理,设为 FALSE 可以提升大文本处理速度。

data.path <- paste(getwd(), '/data/iris.data.csv', sep='')dt <- read.table(data.path, header=T, sep=",")head(dt)
X5.1 X3.5 X1.4 X0.2 Iris.setosa
4.9 3.0 1.4 0.2 Iris-setosa
4.7 3.2 1.3 0.2 Iris-setosa
4.6 3.1 1.5 0.2 Iris-setosa
5.0 3.6 1.4 0.2 Iris-setosa
5.4 3.9 1.7 0.4 Iris-setosa
4.6 3.4 1.4 0.3 Iris-setosa
# 利用 str() 函数查看其信息str(dt)
'data.frame':	149 obs. of  5 variables:
 $ X5.1       : num  4.9 4.7 4.6 5 5.4 4.6 5 4.4 4.9 5.4 ...
 $ X3.5       : num  3 3.2 3.1 3.6 3.9 3.4 3.4 2.9 3.1 3.7 ...
 $ X1.4       : num  1.4 1.3 1.5 1.4 1.7 1.4 1.5 1.4 1.5 1.5 ...
 $ X0.2       : num  0.2 0.2 0.2 0.2 0.4 0.3 0.2 0.2 0.1 0.2 ...
 $ Iris.setosa: Factor w/ 3 levels "Iris-setosa",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...

须知:

如果列名中包含空格,R 会将空格替换为句点。

多数情况下,stringAsFactors 可以设为 FALSE。但是本例中的字符变量表示植物的种类,此处读成因子是正确的。

函数 read.csv() 能够读取 csv 文件,但是功能不如 read.table() —— 后者能处理非 csv 文本。

处理 Excel 文件

读取一个 Excel 文件最佳的方式,是预先将其转为 csv 格式,并用上述的 read.table() 方法读取。

你也可以查找关于 xlsx 包的相关内容,来获知如何直接操作 xlsx 文件。此处略过不提。

可以看一下以前写的文章:

统计软件数据:SAS/SPSS/Stata

需要用到 foreign 包。

SAS:使用 read.ssd()。如果你安装了 SAS,可以使用 Hmisc 包的 sas.get()。

SPSS:使用 read.spss(),或者 Hmisc 包的 spss.get()。

Stata:使用 read.data()。

数据库

一个方法是使用 ODBC 接口。针对你的数据库类型,安装 ODBC 驱动;然后在 R 中安装 RODBC 包。

另一个方法是使用 JDBC 接口,只不过需要 RJDBC 包。

写入文件

在我们对于数据进行清洗之后,往往需要把清洗结果输出到一个新文件中。这里就以 csv 格式为例吧。一个通常的 write.table()/write.csv() 的例子:

write.csv(dt, "filename.csv", row.names=F)

其中 row.names 指定为 FALSE,否则第一列会生成行号一样的数据。

以上为个人经验,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持。如有错误或未考虑完全的地方,望不吝赐教。


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